1、對種植場地環境的處理：1）清潔環境，在菇棚四周開排水溝，及時排除積水；2）在菇棚四周和栽培床架上撒生石灰、噴灑“多菌靈”或“托布津”進行消毒，預防各類病蟲害的發生。
2、對受淹原材料的處理：1）天氣晴朗后，及時進行攤晾、嚗曬；2）或加入3%~5%的石灰進行堆置發酵，發酵結束后再曬干備用。
3、對受淹菌包的處理：1）已污染菌包，要及時進行處理，把污染菌包搬運至離種植場地至少500米的地方進行銷毀或掩埋；2）正在出菇的菌包，先把菌包內的積水倒凈，然后進行散堆，加強通風，待菌絲恢復后再進行出菇管理；3）正在發菌的菌包受淹后，可采取再次滅菌，重新接入菌種再培養（考慮到季節因素，也可接入其它菌種）
