1. 棚內玉木耳菌棒掛完后可以澆水。
2. 通過采取通風、澆水和覆蓋遮陽網、塑料布等措施控制棚溫在16～26℃之間，禁止溫度過高和過低。溫度過高，菌段易污染；溫度過低，耳芽不分化易產生畸形。
3. 通過澆水保持棚內相對濕度在80%～95%，禁止菌棒刀口、菌棒表面發干，否則不易形成原基或憋芽。
4. 棚溫低于16℃禁止澆水，易憋芽；如果棚溫在26℃以上，可以澆水降溫。棚內澆水要均勻，要求棚內澆水為霧化狀態，無明顯水滴。
5. 禁止有未澆到水的菌段出現。
6. 隨著玉木耳耳芽逐漸形成和長大，適當增加棚內澆水量及通風量，在不晾段的情況下，始終保持耳芽濕潤，使其不間斷地生長。
7. 出耳催芽期。該階段管理以控溫保濕為主，通風為輔。
①只要當溫度高于16℃，便可澆水，建議每次澆水5～10分鐘，澆水時間以將全部菌棒表面澆濕為度；當棚溫降到16℃以下，澆水時間應小于5分鐘。
②澆水時棚溫不超過26℃，無須通風，以保濕為主；如超過26℃，須對大棚通風降溫；當溫度降低到22℃以下，可以放下塑料薄膜，保持棚內濕度。
8. 生長期
①當玉木耳子實體長到1厘米以上時應適當加大澆水量，保持耳芽始終處于濕潤狀態，當發現耳芽背面絨毛明顯立起，開始澆下一遍水。
②澆水溫度在14℃以上，適當加強通風，保持棚內二氧化碳含量在1 000微升/升以下，否則易造成耳芽畸形。禁止棚溫超過26℃。
9. 新掛段大棚第一遍水澆水時間在20分鐘左右，要將菌段及刀口表面灰塵沖洗一遍，以防出現污染。
10. 棚內澆水要均勻，要求棚內澆水為霧化狀態，無明顯水滴。大棚微噴頭要勤加處理，防止微噴堵塞造成澆水不均勻，噴頭過濾器每周應清洗一次。
